Étape 3: Photographier les Voxels
La série de voxel doit être photographié avec un microscope à grossissement suffisant pour montrer clairement les voxels croissante, mais suffisamment bas pour afficher plusieurs étapes dans chaque photo, avec suffisamment de chevauchement entre les photos successives d’identifier où, dans la série, chacun d’eux commence et s’arrête.
Si nécessaire, les photos peuvent être redressés à l’aide de Photoshop, GIMP ou autre logiciel de traitement d’image. Puis utilisez GraphClick pour numériser les coins à la base de la denture, en commençant par le côté droit du premier pignon, comme indiqué ci-dessus. Ces coordonnées mesurées à l’exportation vers un fichier texte, avec le même nom de base que le fichier image.
Les images et les fichiers de coordonnées sont alors dirigées par le croquis ci-joint de la transformation (extractFrames.pde) en les plaçant dans un sous-dossier « input ». Il extrait les images de la voxel croissant entre les coordonnées de pignon et enregistre chacun dans un sous-dossier de « sortie ». J’ai également joint mon entrées micrographies et associés fichiers coordonnées et les images créés depuis celles-ci par l’esquisse.
Vous aurez probablement besoin d’ajuster les variables largeur, hauteur et départ pour tenir compte de la résolution de vos propres photographies au microscope. La largeur doit être suffisamment étroite pour exclure les pignons et la largeur et la hauteur doivent être suffisamment grand pour contenir un voxel pleinement exposé plus les couches de base qu’ils sont de plus en plus de certains. L’Offset définit combien de cette base s’affiche. Les dimensions de l’image que j’ai utilisé sont illustrées par un rectangle rouge sur la photo ci-dessus.
Ci-dessus sont également trois images représentant en taille réelle, avec leurs valeurs de gris et les durées d’exposition efficace comme indiqué.
