Étape 5: Étape 5: ImageJ et coutures de l’image
Ce projet repose largement sur une image stitching plugin développé pour imageJ par Stephan Preibisch. Ce plugin peut être trouvé ici : http://fly.mpi-cbg.de/~preibisch/software.html#Sti...
Ce plugin suppose que les images sont nom de manière séquentielle et sont stockés dans le même répertoire. Il vous permet de spécifier l’emplacement relatif de chaque image à travers le modèle qu’ils ont été capturés (par exemple serpent de gauche à droite) et le nombre de colonnes et de lignes. Ce plugin peut être réglé jusqu'à être lot automatisé. Une macro de l’image de base pour contrôler ce script est :
exécuter ("grille/Collection couture", "type = [grille : serpent de lignes] ordre = grid_size_x [droite et vers le bas] = *** nombre de colonnes *** grid_size_y = *** nombre de lignes *** tile_overlap = 35 first_file_index_i = 1 répertoire = [*** Image répertoire ***] file_names = *** nom du répertoire/Image *** _ {iiii} .jpg output_textfile_name=TileConfiguration.txt fusion_method = regression_threshold [mélange linéaire] = 0,30 max/avg_displacement_threshold = 2,50 absolute_displacement_threshold = 3,50 compute_overlap subpixel_accuracy computation_parameters = [économiser de la mémoire (mais plus lente)] image_output = [fusible et affichage]") ;
exécuter ("couleur de RVB") ;
exécuter (« Enregistrer », "sauver = [*** sortie IMAGE nom et répertoire ***]") ;
Close() ;
Close() ;
Veillez à remplacer le texte avec *** les renseignements pertinents.
À ce stade, vous devriez être prêt à aller. Il y a plusieurs façons d’améliorer ce système et, si vous le faites, s’il vous plaît faites le moi savoir.