Conception, assemblage et vérification d’une Nanostructure de Origami ADN 2D (5 / 9 étapes)

Étape 5: stoechiométrie

Pendant que nous attendions pour nos commandes d’arriver de IDT et Tilibit, nous devions faire quelques stoechiométrie pour déterminer le montant exact des produits chimiques et d’ADN à utiliser dans nos expériences.

Étant donné les réactifs :

De Tilibit :

• Échafaudage de 500 μl 100 nM
• Pliante tampon de 500 µl 10 X
• 500 μl 200 mM MgCl2

De IDT

• 111 x 25 nmol agrafes en plaques bien 2 x 96

Supposons une réaction finale de

• 1 tampon X
• 12 mM MgCl
• 20 échafaudage nM
• 200 nM chaque agrafe

Supposons que 1 uL de chaque agrafe remises en suspension sera ajouté à une solution avec un volume final de 200 uL.

Calculer que le volume de MgCl2 nécessaire pour produire une concentration de 12 mM dans une solution de 200 uL donnée 500uL d’une solution de 200 mM.

Calculer le volume de l’échafaudage nécessaire pour produire une concentration 20 nM dans un 200 uL solution donnée 500 uL 100 uM solution.

Calculer le volume de tampon nécessaire pour produire une concentration de 1 x dans une solution de 200 uL donnée 500 uL de 10 X la solution tampon.

N’oubliez pas que 1 tampon X est composée de

• 5 mM Tris
• EDTA 1 mM
• 5 mM NaCl

et donc le tampon X 10 est composée de

• 50 mM Tris
• EDTA 1 mM
• 5 mM NaCl

Cela nous permet de calculer le volume. Alors, prenez un des composants de mémoire tampon et calculer que le volume de Tris nécessaires pour obtenir une concentration de 5 mM dans une solution de 200 uL donnée 500uL d’une solution de 50 mM.

Ou nous pourrions juste réaliser que 10 X 1 X est une dilution de 1/10 !

Maintenant calculer les composantes de la réaction finale données un volume final de 200 uL :

Maintenant calculer le volume de resuspension discontinues et la concentration étant donné le volume de distribution 1 uL et masse 25 nmol de chaque agrafe.