Basiertes ein Raspberry Pi Kamera Mikroskop aus Teilen LEGO (4 / 4 étapes)

Étape 4: Scripte für Aufnahme und Bildauswertung

Wie schon gesagt möchte ich hier später einige einstellen der Mathematica-Scripte, die de für die ich und Bearbeitung Auswertung der Aufnahmen entwickelt habe. Mathematica ist ein sehr mächtiges aber versucht einfach zu programierendes Werkzeug für mathematische Aufgaben (wozu auch Bildverarbeitung gehört) und ist in der Raspian-Distribution für den kostenfrei framboise enthalten.

Mein Augenmerk gal dabei auf einer bestimmten Anwendung, bei der es darum geht die Anzahl, Größe, Form und Intensität env. 30 à 120 µm kleiner Flecken (taches) auf einen env. 5-6 mm großen runden Membran zu seiner Pracht. Der wissenschaftliche Hintergrund hierfür ist das ELISpot- Verfahren, mit dem man z.B. die Stärke der zellulären Immunantwort einer personne oder eines niveaux gegen Krankheitserreger oder Impfstoffe messen kann.

Für die Auswertung muss dabei erstmal die auszuwertende région (« région d’intérêt », retour sur investissement) möglichst sauber ausgewählt werden. Hierzu ist es nützlich die Aufnahme zunächst auf den Deutschland Bereich zu beschneiden.
Dann wird versucht die Deutschland Signale au ROI der vom Hintergrund zu unterscheiden. Hierzu jedoch wird ein eingesetzt Verfahren Schwellwert (seuil), d.h. es wird ein Intensitätswert definiert der Signal und Hintergrund von einander trennt. Hieraus wird dann eine schwarz-weiße Maske erstellt, der die Signale als Blobs abgebildet sind. Anhand von Parametern wie Größe Form und wird dann versucht « echte » von Störsignalen zu unterscheiden. Durch den Einsatz eines gaines d’eau (bassins versants) Verfahrens kann auch noch versucht werden jene Blobs, die eigentlich aus zwei oder mehr benachbarten Flecken Slowenien, dans diese Teile zu zerlegen. Zuletzt wird die überarbeitete Maske dann wieder auf die Aufnahme angewendet, die als « echte » Signale beurteilten taches markiert und deren Eigenschaften Aufnahme der wie z.B. Intensität und Intensitätsverteilung oder Farbe analysiert.

Für solche Aufgaben gibt es zwar auch großartige und sehr mächtige Programme wie ImageJ, welches auch auf dem Raspi läuft. Der Arbeitsablauf ist dort aber meist relativ komplex und besteht aus ob Einzelschritten. Ich hätte aber gerne eine einfach zu bedienende und integrierte Lösung, mit der auch Nicht-Spezialisten arbeiten könnten.

Articles Liés

Raspberry Pi B + Shark Fin cas Lego

Raspberry Pi B + Shark Fin cas Lego

Vous cherchez une affaire Lego Raspberry Pi B + ? Alors vous êtes au bon endroit.J'ai fait ce Instructable car je ne pouvais pas trouver un tutoriel affaire Lego pour le RPi B +.Cette affaire a été conçue avant que j'ai reçu mon RPi(donc si ce n'est
Multiroom Client mit Raspberry Pi ZERO und pHAT DAC

Multiroom Client mit Raspberry Pi ZERO und pHAT DAC

Um eine Multiroomlösung für Webradio und lokale Musik zu realisieren besteht mit dem Raspberry Pi zéro eine günstigere Variante. Mit der Steckplatine von Pimoroni pHAT DAC bleiben die äußeren Abmessungen schön klein. Alors besteht die Möglichkeit die
Birkenholz-Untersetzer aus ganzem Stamm !

Birkenholz-Untersetzer aus ganzem Stamm !

Heute dir ich euch, wie ihr einen rustikalen und dekorativen Untersetzer aus einem Birkenstamm machen könnt. Ja, ihr habt richtig gelesen - wir werden aus einem Stück Ast ein Brett machen, von Anfang bis Ende.Die Werkzeuge :Bandsäge - ihr müsst euch
Das Familienportrait

Das Familienportrait

Wann kriegt man die ganze Familie schon mal zusammen um ein gemeinsames Bild zu machen...Einerseits gehören sich donc selten die Gelegenheit, andererseits sind wir jeden Tag « anders »: glücklich, traurig, stolz auf den selbstgestrickten Schal, mit n
Liliput Juwelen

Liliput Juwelen

Kennst du die Geschichte von Gullivers Reisen ?Gullivers Abenteuerlust führt NHI unter anderem auf eine Insel namens Lilliput. Dort wird er bewusstlos une den Strand gespült und die winzigen den versuchen Bewohner der Insel, aus ihrer Perspektive gig
Heller Lichtwecker

Heller Lichtwecker

Vielen dürfte das problème bekannt sein, vor allem den präventive unter euch : morgens hilft kein Wecker zum wach werden und die de Arbeit ist der Müdigkeit, immer noch nicht verflogen. Das ist weder angenehm noch gut für die Karriere. Bekanntlich gi
RaspRob, le Robot framboise

RaspRob, le Robot framboise

Il s'agit de mon guide How-to créer un robot qui est contrôlée via Internet.La webcam intégrée facilite le robot à contrôler depuis n'importe quel PC ou smartphone ! Nous allons utiliser python pour contrôler les ports GPIO sur notre Pi et le .php po
Impression 3D avec Shapeways.com et Sketchup - décodeur Secret roue !

Impression 3D avec Shapeways.com et Sketchup - décodeur Secret roue !

Mise à jour de l'été 2013 : j'ai reproduit cette roue de décodeur en inox pour un coût comprenant l'expédition de 28,30 $. Très satisfait de la qualité et la convivialité de ce matériau, très difficile de dire que cela se fait par impression 3DJ'ai v
Lichtsensor aus LDR und LED

Lichtsensor aus LDR und LED

Baue einen Lichtsensor aus nur ein paar Teilen !Étape 1: Materialliste und SchaltungEs wird benötigt :StromquelleSteckbrettCavalier KabelOD1LEDAlles zusammenstecken wie in der Zeichnung und testen.
Arduino Steuerung zum Brauchwasser/Abwasser von einer Waschmaschine sparen

Arduino Steuerung zum Brauchwasser/Abwasser von einer Waschmaschine sparen

Beschreibung des Projekt´s Brauchwasser sparenDie Kosten für Energie und Wasser steigen auf einem unverschämten Maß an, und deshalb sollte man sich Gedanken machen, wie man Energie und Wasser sparen kann, damit man seinen Geldbeutel schonen kann.Besc
Google-Président Eric Schmidt Ruft aus China, à Buch

Google-Président Eric Schmidt Ruft aus China, à Buch

http://www.mercurynews.com/business/ci_22602884/google-chairman-eric-schmidt-calls-out-china-bookHong kong nouvelles abney associates business review Google-Président Eric Schmidt Ruft aus China, à BuchGoogle-Président Eric Schmidts Meinung, Chine da
Serveur Web Raspberry Pi

Serveur Web Raspberry Pi

Wenn ihr euer Raspberry PI (2) A / B (+) mit Raspbian und aktiviertem SSH bereit habt, können wir sofort ewsgroups.Für wen ist dieser (Web) serveur geeignet ?Pi de framboise das ist schlicht zu langsam, um eine vollwertiger Server zu sein, était mit
Und noch eine Wordclock

Und noch eine Wordclock

Hallo Leute,Ich sera hier heute mal eine erneute Kopie einer Wordclock sicherlich. Hatte mich meurt Uhr schon beim aller ersten Anblick das Nerdige « Will-Ich-Haben »-Gefühl bekommen.Diese Uhr stellt die Zeit dans Worten da aussi « Es ist viertel nac
Raspberry Pi comme zone de diffusion audio par faible coût

Raspberry Pi comme zone de diffusion audio par faible coût

Cette instructable explique comment étendre votre système audio avec un micro-ordinateur Raspberry Pi à jouer toute la musique locale ou flux audio sur internet (y compris Spotify Premium etc..). La meilleure chose est, que vous n'avez pas besoin d'a